PRITOŽBENA KOMISIJA odloča o pritožbah v zvezi z uresničevanjem pravic in dolžnosti učenca. Imenuje jo svet šole, sestavlja pa jo deset članov, od katerih mora biti več kot polovica strokovnih delavcev šole. O posameznem primeru odloča pet članov komisije, od tega dva zunanja člana.
10-člansko pritožbeno komisijo sestavlja šest strokovnih delavcev šole ( Nika Bobič. Zdenka Ferenc, Darija Nemanič, Janez Turk, Janja Zajc, Klaudija Kokalj), dva predstavnika staršev (Kristoffer Karnel in Nina Levstik), predstavnik ustanovitelja (Rebeka Lea Kovačič) in strokovni zunanji član (Vera Krizmanić).
Pritožbena komisija je imenovana za štiri let, od 28.9.2012 do 28. 9 2016.
